11 исправительных колоний для содержания мужчин;
2 исправительные колонии для содержания женщин;
4 следственных изолятора;
1 лечебно-профилактическое учреждение;
1 лечебно-исправительное учреждение;
1 колония-поселение;
1 тюрьма.
Также в структуру уголовно-исполнительной системы Челябинской области входит уголовно-исполнительная инспекция и 36 ее филиалов.
В г. Магнитогорске располагается областная психиатрическая больница.